生信技能44 - 西湖(中国)生物样本库汉人数据下载和等位基因频率过滤VCF

最新推荐文章于 2026-07-01 13:59:38 发布
原创 最新推荐文章于 2026-07-01 13:59:38 发布 · 700 阅读 · 0 GEO检测
本文介绍了西湖(中国)生物样本库(WBBC)，提供了汉人的基因数据批量下载，并详细解析了VCF文件中的关键信息，如等位基因频率。通过Python脚本`filter_frequency.py`，提取了等位基因频率在0.49-0.51之间的VCF信息。

开发板推荐：天空星STM32F407VET6开发板

超高性价比 STM32主控 | 超高主频 | 一板兼容百芯 | 比赛神器 | 沉金彩色丝印

点击查看

Westlake BioBank for Chinese (WBBC) 西湖(中国)生物样本库

WBBC，施一公当校长的西湖大学，共纳入~15000个样本，目前提供了hg19和hg38两个版本的数据下载。

WBBC网址：https://wbbc.westlake.edu.cn/downloads.html

1. 可用数据（汉人）

在这里插入图片描述

WBBC网站

2. 批量下载数据（hg38/hg19）

后台下载
nohup sh download_WBBC.sh > download.log 2&>1 &

# download_WBBC.sh

开发板推荐：天空星STM32F407VET6开发板

超高性价比 STM32主控 | 超高主频 | 一板兼容百芯 | 比赛神器 | 沉金彩色丝印

点击查看
标签
#数据分析 #数据挖掘 #linux
了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
中国西湖生物样本库WBBC
多组・学・多组学
07-17 1045
本文启动了中国西湖生物样本库（WBBC）试点项目，该项目涵盖了 4,535 名全基因组测序（WGS）的个体以及 5,841 名高密度基因分型的个体，并鉴定出了 8,150 万个单核苷酸多态性（SNP）和插入缺失变异（INDEL），其中 38.5% 在 dbSNP 数据库第 151 版中未被收录。提供了特定人群的参考面板以及在线基因填补服务器（https://wbbc.westlake.edu.cn/），能显著提升在中国人群中基因填补的性能，尤其是对于低频和罕见变异。
西湖大学鞠峰组：环境宏病毒组学分析思路与常用工具
热门推荐
刘永鑫的博客——宏基因组公众号
06-25 1万+
环境宏病毒组学分析思路与常用工具袁凌1, 2，倪艳4，鞠峰1, 2, 3 *1 浙江省海岸带环境与资源研究重点实验室，工学院, 西湖大学, 杭州, 浙江2 前沿技术研究所, 浙江西湖高...
Week 4 --Day 3：项目三 — 数据分析智能体
喵叔
06-27 267
一个对数据库结构一无所知的模型不可能凭空写出能正确执行的查询语句，因此在 SQL 生成之前，系统必须先执行一个 Schema 探查步骤，自动列出数据库中所有可用的表名，然后根据问题的语义选择相关的表并获取其详细的列定义。这段解析代码使用了简单的字符串分割和类型推断，虽然在实际项目中更好的做法是在节点间传递结构化的 JSON 数据而非文本，但文本格式的优点是 LLM 可以直接阅读和理解中间结果，便于调试时通过 LangSmith 或终端日志追踪数据流转的每一步。字段筛选出不同等级的用户，再与订单表联查求和。
从FineBI到FineBINext：一条企业数据分析的AI升级路径
Leo的博客
06-29 329
面对企业数据分析的瓶颈，FineBI提出三阶段渐进式AI升级方案。第一阶段夯实BI底座，建立统一指标中心、自助分析体系和企业级管控能力；第二阶段通过AI+BI实现自然语言交互分析，确保结果可信且可溯源；第三阶段升级为分析Agent，自动完成取数、归因、预警等闭环分析，并封装行业经验为场景Agent。区别于纯AI工具，FineBINext继承原有数据治理体系，支持三级溯源验证，已在一汽、柳工等企业实现经营分析、供应链预警等场景落地。
基于机器学习的地震数据挖掘与应急避险服务系统，集数据管理、可视化分析与智能预测于一体的综合性地震数据分析平台
weixin_49081159的博客
06-27 422
地震灾害以其突发性强、破坏性大、影响范围广等特点，长期以来对人类社会的生存与发展构成严峻挑战。根据美国地质调查局（USGS）统计数据显示，全球每年平均发生约五十万次可被探测到的地震，其中具有破坏性的五级以上地震约千余次，造成重大人员伤亡和财产损失的强震亦时有发生。中国地处环太平洋地震带与欧亚地震带交汇区域，地震活动频繁，近二十年来先后发生汶川地震、玉树地震、芦山地震等重大地震灾害，防震减灾工作始终面临巨大压力。当前，国内外地震监测机构已积累了海量的历史地震数据，USGS、中国地震台网中心等平台均提供公开的地
基于ArcGIS、ENVI、InVEST、FRAGSTATS等多技术融合提升环境、生态、水文、土地、土壤、农业、大气等领域的数据分析能力与项目科研水平
CCfz566的博客
06-30 239
3.5 地理变换：BJ54、XIAN80、WGS84与CGCS2000。5.2 基于DEM的表面分析：高程、坡度、坡向、等值线、山体阴影。6.4 空间插值分析：反距离权重法、克里金法、地统计学工具使用。7.2 土地利用的分类提取：重分类、栅格转矢量、融合处理。3.6 矢量数据的空间分析（空间叠加分析、缓冲区分析）5.3 基于DEM的水文分析：河网、盆域、集水区、坡降。11.4 基于InVEST模型的土地利用碳储量分析。9.4 基于InVEST模型的土壤侵蚀模拟及分析。
广西气候环境数据分析与可视化系统：从历史天气采集到大屏联动展示
迷茫与徘徊只会让你陷入绝境，欢迎私信博主，带你开始提升变现价值！
06-26 324
本文介绍了一个基于Python的广西气候环境数据分析与可视化系统。项目从公开历史天气数据采集入手，通过爬虫获取广西14个地级市2020-2025年的气象数据，经过清洗、结构化处理后存入MySQL数据库。系统采用Flask框架搭建Web服务，前端使用Pyecharts和ECharts实现多样化可视化展示，并运用LSTM和GRU模型进行AQI短期预测。系统功能完整，包含用户登录注册、数据可视化、后台管理、动态大屏等模块，支持多维度气候指标分析，如空气质量、天气类型、风向风力、温度变化等。项目突破了传统数据分析仅
AI办公工具实测：ChatExcel 与 WorkBuddy 在数据分析和任务执行上的差异
chatexcel的博客
06-25 335
对比 ChatExcel 与 WorkBuddy 两类 AI办公工具，从数据分析、异常识别、报告生成、模板回填和办公执行等维度，帮你判断不同场景下该选哪款 AI工具。
python学习笔记5-实战篇-数据分析
qingwufeiyang_530的专栏
06-24 673
安装pandas。
2026年指标分析系统推荐：指标体系管理与多维度数据分析能力对比
technology_x的博客
06-26 158
在2026年的指标分析系统选型中，指标体系管理能力、数据口径统一机制、分析可视化深度、智能预警成熟度和行业适配广度是五个核心评估维度。SmartBI Insight凭借其完整的一站式指标管理闭环、在IDC7项平台技术能力评分第一的技术实力、金融行业IDC市占率排名第一的行业地位，以及服务超过5000家客户、覆盖60余个行业的实践经验，在本次对比中展现出较为全面的综合实力。作为国家级专精特新"小巨人"企业。
当开源埋点系统遇上AI ：ClkLog实现对话式的数据分析
ClkLog的博客
06-26 229
对于ClkLog来说，这次发布API Skill并不仅仅是增加一个AI功能，而是希望让ClkLog的数据能力能够更方便地接入未来的AI生态。希望通过 AI 与数据分析能力的结合，为运营、产品和数据团队提供更加便捷的数据使用体验。如果数据无法被外部系统和智能体便捷调用，那么AI的价值也难以真正落地到业务场景中。以下场景中的数据均来自 ClkLog，AI负责理解问题、调用接口并生成分析结果。API Skill 的发布，是我们在开放数据能力上的一次新尝试。随着业务增长，系统中的功能、报表和配置项越来越丰富。
以Kimball模型高效赋能企业BI数据分析
德昂信息博客
06-26 218
本文针对企业BI分析口径混乱、查询低效、数据不统一等痛点，介绍Kimball模型的核心建模理念与数仓落地思路，讲解其如何通过标准化数据建模适配BI多维分析与可视化场景，助力企业实现数据统一、高效分析与精细化业务决策。
赛事数据分析核心指标大全，AI助力赛事高效复盘
2601_95493743的博客
06-30 225
无需人工盯场统计，AI相机实时捕捉赛场每一个细节，精准输出全维度赛事数据分析指标，适配足球、篮球、羽毛球、网球、匹克球、冰球、橄榄球、排球全品类球类赛事，完美适配民间赛事、商业赛事、校园赛事、专业赛事等多场景需求。防守端核心指标：拦截次数、解围次数、封堵次数、防守成功率、被射门次数、失球数、对抗成功率。赛事数据分析、体育赛事数据指标、AI赛事直播、运动相机赛事统计、球类赛事数据复盘、赛事智能化运营、篮球赛事数据、足球赛事分析、匹克球赛事统计、AI体育赛事系统、赛事数据可视化、体育赛事运营优化。
计步器算法原理及数据分析
最新发布
lizhengyu891231的博客
07-01 212
传感器与算法结合：手机通过TYPE_STEP_COUNTER等传感器实时采集数据，经滤波、周期信号识别等算法提升准确性，部分高端机型还支持与智能手表/手环联动，获取更全面的运动数据。- 算法可能使用低通、高通和带通滤波器等。- 步数统计：通过手机内置传感器（如加速度计、陀螺仪）捕捉运动时的加速度变化，经算法过滤噪声后计算步数，可查看当日总步数、有效步数等核心指标。- 周期数据对比：查看日、周、月甚至年的步数趋势图表，识别活动模式（如工作日与周末的步数差异），判断运动习惯是否规律。
数据分析转大模型：实践笔记 09
2601_96285276的博客
06-30 296
本文概述文章目标、核心观点和实践价值。摘要：很多做传统 BI 和报表开发的同学觉得焦虑，觉得 SQL 和 Tableau 要被 LLM 取代了。其实不然，真正的机会在于从“被动看数”转向“主动问数”。本文不聊虚的概念，直接拆解如何将你的数据分析经验转化为一个可展示的“智能分析 Agent”项目。我会以求职作品集为导向，分享从需求定义、架构选型到最终代码实现的完整路径，帮你把原本藏在 Excel 里的业务逻辑，变成面试官眼前亮眼的工程能力。Agent 的核心在于它的能力边界。
基于Python实现北极星日淘用户行为数据分析与可视化
beijixingRT的博客
06-27 277
本文基于Python Pandas + Matplotlib，对北极星用户行为日志进行清洗、统计、分析，实现品类热度、用户转化率、区域分布数据可视化，为平台选品、运营活动、品类优化提供数据支撑，附完整分析源码与可视化图表。原始数据存在空值、重复数据、无效日志等问题，首先通过Pandas完成数据清洗：删除重复日志、填充空值、过滤机器人访问、筛选有效用户行为数据，标准化时间、品类、行为类型字段，为后续统计分析奠定数据基础。# 3、品类热度统计（文具、厨具、日化、中古、周边）plt.xlabel("商品品类")
HarmonyOS 6（API 23）实战：基于HMAF的「基因织网」——PC端AI智能体生物信息学与基因组数据分析协作平台
从事移动开发八年，csdn博客专家，阿里云特邀专家，华为云云享专家，高级网络信息安全工程师，大数据工程师（高级），python技术开发（高级），HarmonyOS 应用开发者高级认证，现在某学校任教。
06-29 1380
随着2026年精准医疗和基因编辑技术的飞速发展，基因组数据分析已成为生命科学领域的核心引擎。全基因组测序（WGS）、外显子组测序（WES）、单细胞转录组分析等技术的普及，使得生物信息学家每天需要处理TB级别的序列数据。然而，传统的生物信息学分析工具存在以下痛点：2026年，生物信息学已从"辅助工具"进化为"核心发现引擎"，在精准医疗、分子育种、进化生物学等领域，算力基础设施的质量直接决定了数据分析的速度和成本。本文将基于 HarmonyOS 6（API 23），利用 悬浮导航（Floating Naviga
018-数据分析能力的刻意练习
davy800405的博客
07-01 222
"数据驱动决策"已经成为几乎所有企业的共识。随便打开一个招聘网站，数据分析能力几乎出现在每一个岗位描述中——产品经理要分析用户行为，运营要分析转化漏斗，市场要分析ROI，就连HR也开始用数据做人才盘点。人人都在说数据，人人都在谈论数据思维，但真正能用数据说话的人，其实并不多。为什么？因为会说"我们要用数据说话"和真正"能用数据说话"之间，隔着一条巨大的鸿沟。。大多数人的数据分析能力停留在"会用Excel做柱状图"或"能写几句SQL查数"的层面。
Python大数据实战（八）：SVM回归+极区图——气象数据分析与可视化全流程实战
tigerhhzz的博客
06-29 300
靠海的城市是不是更凉快？每到夏天，这个问题总会浮现在脑海。住在内陆城市的人羡慕海边的凉爽，而海边的人却说"也没差多少"。那么，海洋到底对气候有多大影响？这个看似感性的问题，其实可以用数据科学给出一个理性的答案。本文将以意大利波河流域的 10 个城市为研究对象，使用 Python 对气象数据（温度、湿度、风向、风速）进行全面的分析与可视化。我们将使用matplotlib绘制多种图表，使用scikit-learn 的 SVR（支持向量回归）对温度与离海距离的关系进行建模，并使用极区图（玫瑰图）展示风向分布。
第12天 ROS Noetic 《Gazebo仿真保姆级教程：激光雷达、摄像头传感器建模+RViz可视化+话题数据分析》
z5mm6的博客
06-30 233
本文提供基于Ubuntu20.04+ROS Noetic+Gazebo11的机器人传感器仿真教程，包含激光雷达和摄像头两个独立实验。详细指导URDF建模、Gazebo插件配置、RViz可视化及ROS话题数据分析。激光雷达实验实现360°扫描仿真，摄像头实验完成图像采集仿真。教程采用分步讲解方式，适合ROS新手入门学习，每个实验预计45分钟完成，最后还提供多传感器融合的拓展方案。通过本教程，读者可掌握机器人传感器仿真的核心流程，包括Gazebo插件使用、ROS消息解析等关键技术。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

生信与基因组学

每一份鼓励是我坚持下去动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值