三代测序结构变异分析 - 单样本Germline SV calling和多样本SV Calling

最新推荐文章于 2026-05-13 05:57:35 发布
原创 最新推荐文章于 2026-05-13 05:57:35 发布 · 914 阅读 · 1 GEO检测

适用于三代PacBio HiFi / ONT 长reads数据的结构变异分析。

1. sniffles2安装

sniffles2需要Python >= 3.10环境，因此用conda创建安装好3.10的环境。

sniffles2安装要求：

  • Python >= 3.10
  • pysam >= 0.21.0
  • edlib >=1.3.9
  • psutil>=5.9.4
# 创建conda环境
conda create -n py3.10 python=3.10

conda install sniffles=2.4
标签
#linux #数据分析 #数据挖掘
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