【机器学习】DBSCAN聚类算法——原理、参数调优与实战

简介

本次我们将聚焦于一款极具特色的聚类算法——DBSCAN。相较于 K-means 等需要预先指定簇数量的算法,DBSCAN 以其"无监督自适应"的特性,在聚类领域占据着不可替代的地位。

在这一课中,我们会深入剖析 DBSCAN 算法的核心原理。你将了解到它如何通过"密度可达"和"核心对象"等关键概念,自动发现数据集中任意形状的簇,还能识别出那些不属于任何簇的噪声点。这一特性让它在处理非凸形状、存在噪声的数据时,展现出远超传统聚类算法的优势。

一、DBSCAN 相关概念

核心概念图解

DBSCAN(Density-Based Spatial Clustering of Applications with Noise)是一种基于密度的空间聚类算法。它将簇定义为密度相连的点的最大集合,能够将具有足够高密度的区域划分为簇,并在噪声数据中发现任意形状的聚类。

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核心术语详解

术语定义
核心对象(Core Point)如果某个点的 Eps 邻域内包含的样本数量 ≥ MinPts,则该点为核心对象
Eps 邻域给定对象半径 Eps 内的区域,即以该点为中心、Eps 为半径的圆形区域
直接密度可达如果点 p 在点 q 的 Eps 邻域内,且 q 是核心对象,则称 p 从 q 直接密度可达
密度可达存在一个点链 p₁, p₂, …, pₙ,使得每个点都从上一个点直接密度可达
边界点(Border Point)在某个簇内,但自身不是核心对象的点
离群点(Outlier / Noise)既不是核心对象也不是边界点,不属于任何簇的点

算法实现流程

  1. 输入数据集
  2. 指定半径 Eps
  3. 指定密度阈值 MinPts
  4. 遍历所有点,标记核心对象
  5. 对每个核心对象,找出其密度可达的所有点,形成簇
  6. 将不在任何簇中的点标记为噪声

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二、DBSCAN 的 API

class sklearn.cluster.DBSCAN(
    eps=0.5, 
    min_samples=5, 
    metric='euclidean', 
    metric_params=None, 
    algorithm='auto', 
    leaf_size=30, 
    p=None, 
    n_jobs=None
)

核心参数说明

参数说明
eps邻域半径,决定了一个点的邻域范围,默认 0.5
min_samples构成核心点所需的最少样本数(密度阈值),默认 5
metric距离度量方式,默认 ‘euclidean’(欧氏距离)
metric_params度量函数的额外参数,默认 None
algorithm近邻搜索算法,‘auto’ 表示自动选择(ball_tree / kd_tree / brute)
leaf_size构建 BallTree 或 KDTree 时的叶子节点大小,默认 30
p闵可夫斯基距离的阶数(p=2 为欧氏距离,p=1 为曼哈顿距离)
n_jobs并行计算的 CPU 核心数,-1 表示使用所有核心

三、案例分析

1. 导入所需库

import pandas as pd
from sklearn.cluster import DBSCAN
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.metrics import adjusted_rand_score, normalized_mutual_info_score
import numpy as np

2. 数据读取与标准化

# 读取训练集和测试集数据
data_train = pd.read_csv("datingTestSet2.txt", sep='\t', encoding='utf-8', engine='python', header=None)
data_test = pd.read_csv("datingTestSet1.txt", sep='\t', encoding='utf-8', engine='python', header=None)

# 标准化处理(DBSCAN 基于距离,必须进行标准化)
scaler = StandardScaler()
data_train.iloc[:, :-1] = scaler.fit_transform(data_train.iloc[:, :-1])
data_test.iloc[:, :-1] = scaler.transform(data_test.iloc[:, :-1])

3. 数据准备

x_train = data_train.iloc[:, :-1]   # 训练集特征
x_test = data_test.iloc[:, :-1]     # 测试集特征
y_train_true = data_train.iloc[:, -1]  # 训练集真实标签
y_test_true = data_test.iloc[:, -1]    # 测试集真实标签

4. DBSCAN 参数调优

# 测试不同的 eps 参数
scores = []
eps_param_range = [0.09, 0.1, 0.2, 0.3, 0.4, 0.5, 0.6]

for eps in eps_param_range:
    dbscan = DBSCAN(eps=eps, min_samples=2)
    train_labels = dbscan.fit_predict(x_train)
    
    # 忽略噪声点(标签为 -1)进行评估
    mask = train_labels != -1
    if np.sum(mask) > 0:
        ari = adjusted_rand_score(y_train_true[mask], train_labels[mask])
        nmi = normalized_mutual_info_score(y_train_true[mask], train_labels[mask])
        score_mean = (ari + nmi) / 2
        scores.append(score_mean)
        print(f"eps = {eps},平均得分 (ARI+NMI)/2 = {score_mean:.4f}")
    else:
        print(f"eps = {eps},所有样本均被标记为噪声")
        scores.append(-1)

5. 确定最佳参数并输出结果

# 选择最佳 eps
best_eps = eps_param_range[np.argmax(scores)]
print(f"最优 eps 参数:{best_eps}")

# 使用最佳参数重新训练
best_dbscan = DBSCAN(eps=best_eps, min_samples=2)
train_labels = best_dbscan.fit_predict(x_train)
print("训练集聚类标签:\n", train_labels)

# 对测试集进行聚类
test_labels = best_dbscan.fit_predict(x_test)
print("测试集聚类标签:\n", test_labels)

总结

DBSCAN 的优势
无需预先指定簇数量:自动发现数据中的聚类结构

可发现任意形状的簇:不同于 K-means 只能发现球形簇

具有噪声过滤能力:能自动识别并剔除离群点

关键参数调优建议

参数调优方法
eps使用 k-distance 图辅助确定;或通过网格搜索结合评估指标选择
min_samples一般取数据维度的 2 倍或更大;数据量较大时可适当增加

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