5、生物医学数据建模：EER 概念模式与关系映射

生物医学数据建模：EER 概念模式与关系映射

在生物医学数据建模领域，新的 EER（扩展实体 - 关系）符号和概念为我们提供了强大的工具，用于构建分子生物系统的语义数据模型。下面将详细介绍这些新的关系类型、语义数据模型以及如何将 EER 模型映射到关系数据库中。

1. 新 EER 符号概述

新的 EER 关系为基本的 ER 模型概念增添了强大的建模和表示能力，且其符号并不复杂，易于使用。以下是新 EER 关系及其用途的总结：
| EER 关系 | 注释 |
| — | — |
| 无序集 | 一般关系，实例唯一 |
| 有序集 | 将具有排序特征的实体关联起来，关系实例唯一 |
| 无序包 | 将无排序特征的实体关联起来，关系实例可重复 |
| 有序包 | 将具有排序特征的实体关联起来，关系实例可重复 |
| 过程 | 通过实体在过程中扮演的角色（输入、输出和催化剂）将不同实体关联起来 |
| 分子空间 | 在 3D 空间中将原子实体与分子实体关联起来 |

2. 分子生物系统的语义数据模型

分子生物系统的 EER 概念模式大致分为三个部分：DNA/基因序列、蛋白质结构和分子相互作用与途径。

2.1 DNA/基因模型

DNA 序列由四种核苷酸碱基按特定顺序组成，基因是具有特定功能的 DNA 序列片段。DNA 序列通常来自不同生物来源，这些生物有完善的系统发育分类模式。

在建模 DNA/基因序列关系时，有多种选择：
- 二元关系类型 ：基因和非基因分别与 DNA 序列具有